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Classe des Leotiomycetes

Les Leotiomycetes comprennent 10 ordres, 60 familles, 925 genres et plus de 10 000 espèces. Il s’agit principalement de petits champignons cupuliformes, produisant des apothécies (organes de fructification ouverts, en forme de disque ou de coupe) comprenant un hyménium (couche productrice de spores) composé d’asques à paroi unique qui n’ont pas de couvercle apical (opercule), mais libèrent leurs ascospores hyalines et unicellulaires à travers un pore apical.

Cette base de données comprend des espèces pertinentes pour la pathologie forestière appartenant à quatre ordres de Leotiomycetes : Chaetomellales, Helotiales, Phacidiales et Rhytismatales.

Ordre des Chaetomellales

Les Chaetomellales comprennent 2 familles, 20 genres et plus de 170 espèces. Elles produisent de petites apothécies, souvent de couleur vive, dans les tissus végétaux en décomposition ou parfois vivants.

Famille des Marthamycetaceae

Cette famille comprend des espèces caractérisées par des apothécies de petite taille, souvent de couleur vive, qui sont partiellement incrustées dans leur substrat végétal. Les asques dans l’hyménium sont cylindriques ou en forme de massue, avec un apex arrondi, et contiennent généralement huit ascospores. Les ascospores hyalines varient d’ellipsoïdes à minces, élancées et septées, et ont parfois une gaine gélatineuse. Les espèces sont saprophytiques sur le matériel végétal mort, et rarement parasites sur le feuillage des conifères.

Ordre des Helotiales

Les Helotiales constituent un très grand ordre de champignons comprenant 42 familles, 708 genres et plus de 8 400 espèces. Les membres de cet ordre se caractérisent par des ascocarpes (apothécies) en forme de coupe, généralement recouverts de longs poils cylindriques.

Famille des Cenangiaceae

Cette famille d’espèces se compose de champignons apothéciaux avec un hyménium constitué d’asques cylindriques ou en forme de massue, dont l’extrémité se colore généralement en bleu lorsqu’elle est exposée au réactif de Melzer. Les asques ont huit spores et sont entrecoupés de paraphyses septées, d’une forme rappelant légèrement la massue. Les ascospores sont incolores, ellipsoïdes à globulaires et comptent une seule cellule ou jusqu’à deux septums. Lorsqu’elles sont présentes, les conidies (spores asexuelles) sont produites dans des pycnides. Certaines espèces produisent des apothécies sur le feuillage des conifères, provoquant la maladie du rouge.

Famille des Drepanopezizaceae

Cette famille d’espèces est constituée d’agents phytopathogènes associés à la brûlure foliaire et à la brûlure des rameaux des feuillus et des plantes à feuilles larges. Les espèces produisent des apothécies qui sont le plus souvent enfouies dans les tissus de l’hôte. Les ascospores sont généralement ellipsoïdes, incolores et unicellulaires ou comptent un à deux septums. Les conidies sont produites dans des acervules, qui sont des masses de cellules conidiogènes en forme de soucoupe où les conidies percent l’épiderme de l’hôte. Deux types de conidies se forment souvent dans les acervules : les macroconidies, de forme ellipsoïde ou en goutte d’eau et souvent légèrement incurvées, et les minuscules microconidies unicellulaires.

Famille des Erysiphaceae

Cette famille d’espèces est constituée d’agents phytopathogènes associés à la brûlure foliaire et à la brûlure des rameaux des feuillus et des plantes à feuilles larges. Les espèces produisent des apothécies qui sont le plus souvent enfouies dans les tissus de l’hôte. Les ascospores sont généralement ellipsoïdes, incolores et unicellulaires ou comptent un à deux septums. Les conidies sont produites dans des acervules, qui sont des masses de cellules conidiogènes en forme de soucoupe où les conidies percent l’épiderme de l’hôte. Deux types de conidies se forment souvent dans les acervules : les macroconidies, de forme ellipsoïde ou en goutte d’eau et souvent légèrement incurvées, et les minuscules microconidies unicellulaires.

Famille des Gelatinodiscaceae

Cette famille d’espèces se compose principalement de champignons saprophytiques, gélatineux et apothéciaux, dont certains sont associés à la pourriture du bois. Les asques se colorent en bleu lorsqu’ils sont exposés au réactif de Melzer et produisent des ascospores jaunâtres à brunâtres à parois lisses qui ont généralement une enveloppe gélatineuse. Les ascospores sont unicellulaires ou présentent de un à cinq septums.

Famille des Godroniaceae

Cette famille d’espèces se compose d’agents pathogènes des plantes qui provoquent des brûlures sur les pousses et des chancres sur les tiges, et produisent des apothécies foncées en forme de disque ou de coupe en grappes à partir d’une base commune. L’hyménium produit des asques cylindriques portant huit ascospores incolores et septées qui ont une forme ellipsoïde avec des extrémités pointues (fusoïde). Des pycnides foncées se développent également à proximité des apothécies, produisant des conidies septées incolores dont la forme varie d’arrondie à cylindrique et incurvée.

Famille des Lachnaceae

Cette famille comprend des espèces saprophytiques et parasites, certaines de ces dernières provoquant des chancres sur les conifères. La plupart des espèces forment des apothécies souvent pédonculées et extérieurement poilues, avec un hyménium jaune à orange. Les asques cylindriques produisent des ascospores de formes variées, allant de globulaires à filiformes. Les conidies sont produites dans des pycnides.

Famille des Ploettnerulaceae

Cette famille comprend des espèces saprophytiques et parasites, dont certains agents pathogènes faibles des aiguilles de conifères. La plupart des espèces produisent des organes de fructification apothéciaux, souvent recouverts extérieurement de poils foncés. Les asques cylindriques ont des parties apicales coniques qui se colorent en bleu lorsqu’elles sont exposées au réactif de Melzer. La morphologie des ascospores varie d’ellipsoïde à filiforme, et d’aseptée à comptant trois septums. Les conidies sont produites soit sur des cellules conidiogènes sur des hyphes nus, soit dans des pycnides.

Famille des Sclerotiniaceae

Cette famille se compose d’espèces saprophytiques et parasites qui produisent des organes de fructification apothéciaux, se formant généralement sur des sclérotes (masses arrondies d’hyphes, souvent noires, formant des structures dormantes dans les tissus végétaux). Certaines espèces provoquent la maladie de la « tache d’encre » sur le feuillage des feuillus, ainsi nommée en raison de l’aspect des sclérotes dans les feuilles. Les asques se colorent généralement en bleu lorsqu’ils sont exposés au réactif de Melzer et produisent des ascospores généralement ellipsoïdes, incolores, à parois lisses et comptant de un à trois septums, qui bourgeonnent souvent à l’intérieur de l’asque.

Ordre des Phacidiales

Les Phacidiales comprennent 2 familles, 36 genres et 210 espèces. Les membres sont saprophytiques ou parasites, et certains sont associés à des maladies des aiguilles chez les conifères. Ils produisent des apothécies qui sont généralement foncées et recouvertes d’une couche supérieure de tissu fongique (excipulum) qui se rompt pour exposer l’hyménium. Les conidies (spores asexuelles) sont produites dans des pycnides.

Famille des Hamatocanthoscyphaceae

Cette famille se compose d’espèces saprophytiques et parasites associées aux brûlures foliaires et des rameaux. Les espèces forment des stromas dans les tissus végétaux qui se transforment en apothécies recouvertes d’une couche de tissu fongique foncé (excipulum). Les asques sont cylindriques ou en forme de massue, et les ascospores sont hyalines, de forme ellipsoïde à fusoïde, sans septum ou avec un septum. Les conidies sont produites dans des pycnides et sont unicellulaires, variant de presque cylindriques à elliptiques, et certaines ont un appendice mucilagineux.

Ordre des Rhytismatales

Les Rhytismatales comprennent 3 familles, 79 genres et plus de 710 espèces de champignons saprophytiques ou pathogènes, dont beaucoup fructifient sur les surfaces supérieures du feuillage de l’hôte, où elles provoquent des « taches goudronneuses » sur les feuillus, et les maladies du rouge sur les conifères. Les espèces de cet ordre produisent généralement des stromas ou des ascocarpes foncés qui résistent à la sécheresse et s’ouvrent par des fissures dans la surface supérieure de la feuille ou de l’aiguille par temps humide pour exposer l’hyménium.

Famille des Rhytismataceae

À l’origine, les espèces de cette famille étaient collectivement appelées champignons de « taches goudronneuses » en raison de l’aspect des apothécies de certains genres sur le feuillage des feuillus. Les études génétiques ont élargi le concept de cette famille pour y inclure de nombreux genres responsables des maladies du rouge sur les conifères, ainsi que des espèces présentant d’autres types d’organes de fructification, dont certains sont même longs et pédonculés. Les apothécies, quelle que soit leur forme, s’ouvrent par des fentes ou des fissures pour exposer l’hyménium composé d’asques cylindriques et de paraphyses (filaments hyphaux stériles). Les ascospores sont très variables au sein de cette famille, mais beaucoup sont recouvertes d’une gaine gélatineuse. Les conidies (spores asexuelles), lorsqu’elles sont présentes, se forment dans des pycnides. Les genres associés au rouge forment souvent des ascocarpes allongés parallèlement à l’axe long de l’aiguille, appelés hystérothèces.